home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Big Green CD 8 / BGCD_8_Dev.iso / NEXTSTEP / UNIX / Educational / R-0.49-MI / R-0.49-I / help / survival4 / coxph.object < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1997-09-13  |  2.9 KB  |  81 lines
  1.     
  2.     _P_r_o_p_o_r_t_i_o_n_a_l _H_a_z_a_r_d_s _R_e_g_r_e_s_s_i_o_n _O_b_j_e_c_t _T_h_i_s _c_l_a_s_s _o_f _o_b_j_e_c_t_s
  3.     _i_s _r_e_t_u_r_n_e_d _b_y _t_h_e _c_o_x_p_h _c_l_a_s_s _o_f _f_u_n_c_t_i_o_n_s _t_o _r_e_p_r_e_s_e_n_t _a
  4.     _f_i_t_t_e_d _p_r_o_p_o_r_t_i_o_n_a_l _h_a_z_a_r_d_s _m_o_d_e_l.  _O_b_j_e_c_t_s _o_f _t_h_i_s _c_l_a_s_s
  5.     _h_a_v_e _m_e_t_h_o_d_s _f_o_r _t_h_e _f_u_n_c_t_i_o_n_s _p_r_i_n_t, _s_u_m_m_a_r_y, _r_e_s_i_d_u_a_l_s,
  6.     _p_r_e_d_i_c_t _a_n_d _s_u_r_v_f_i_t.
  7.     
  8.          The following components must be included in a legiti-
  9.          mate coxph object.
  10.     
  11.     _A_r_g_u_m_e_n_t_s:
  12.     
  13.      coefficients:
  14.          the coefficients of the linear predictor, which multi-
  15.          ply the columns of the model matrix.  If the model is
  16.          over-determined there will be missing values in the
  17.          vector corresponding to the redundant columns in the
  18.          model matrix.
  19.     
  20.               var:
  21.          the variance matrix of the coefficients.  Rows and
  22.          columns corresponding to any missing coefficients are
  23.          set to zero.
  24.     
  25.         naive.var:
  26.          this component will be present only if the robust
  27.          option was true.  If so, the var component will contain
  28.          the robust estimate of variance, and this component
  29.          will contain the ordinary estimate.
  30.     
  31.            loglik:
  32.          a vector of length 2 containing the log-likelihood with
  33.          the initial values and with the final values of the
  34.          coefficients.
  35.     
  36.             score:
  37.          value of the efficient score test, at the initial value
  38.          of the coefficients.
  39.     
  40.              iter:
  41.          number of iterations used.
  42.     
  43.               icc:
  44.          the intra-class correlation coefficient.  This is only
  45.          present if a cluster term appeared in the model and the
  46.          number of subjects per cluster was >1.  It is a vector
  47.          containing the number of clusters, the intra-class
  48.          correlation of the martingale residuals, and the icc of
  49.          the ranked residuals.  Because the residuals are
  50.          skewed, the latter may differ from the ordinary icc.
  51.     
  52.     linear.predictors:
  53.          the vector of linear predictors, one per subject.
  54.     
  55.         residuals:
  56.          the martingale residuals.
  57.     
  58.             means:
  59.          vector of column means of the X matrix.  Subsequent
  60.          survival curves are adjusted to this value.
  61.     
  62.                 n:
  63.          the number of observations used in the fit.
  64.     
  65.           weights:
  66.          the vector of case weights, if one was used.
  67.     
  68.            method:
  69.          the computation method used.
  70.     
  71.         na.action:
  72.          the na.action attribute, if any, that was returned by
  73.          the na.action routine.  The object will also contain
  74.          the following, for documentation see the lm object:
  75.          terms, assign, formula, call, and, optionally, x, y,
  76.          and/or frame.
  77.     
  78.          survfit, coxph.detail, cox.zph, survreg,
  79.          residuals.coxph.
  80.     
  81.