home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #23 / NN_1992_23.iso / spool / sci / compaid / 184 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-10-16  |  2.9 KB
  1. Path: sparky!uunet!know!cass.ma02.bull.com!think.com!ames!elroy.jpl.nasa.gov!sdd.hp.com!caen!uwm.edu!ogicse!mimbres.cs.unm.edu!cs.sandia.gov!twarnow
  2. From: twarnow@cs.sandia.gov (Tandy Warnow)
  3. Newsgroups: sci.comp-aided
  4. Subject: Announcement of Workshop on Algorithms for Molecular Sequence Alignment
  5. Summary: Nov. 5 and 6, 1992, in Albuquerque, NM
  6. Message-ID: <1992Oct16.175249.12358@cs.sandia.gov>
  7. Date: 16 Oct 92 17:52:49 GMT
  8. Sender: usenet@cs.sandia.gov (Another name for news)
  9. Organization: Sandia National Laboratories, Albuquerque, NM
  10. Lines: 75
  11.  
  12.  
  13.                       Tutorial and Workshop on
  14.              Algorithms for Molecular Sequence Alignment
  15.  
  16.  
  17.                          Nov. 5 - 6, 1992
  18.               University of New Mexico, Albuquerque, NM
  19.  
  20. Sandia National Laboratories and the Computer Science Department at 
  21. the University of New Mexico are pleased to announce a tutorial and 
  22. workshop on {\em Algorithms for Molecular Sequence Alignment}, to be 
  23. held on Nov. 5 and 6, 1992, at the University of New Mexico, in 
  24. Albuquerque, NM.  The tutorial is designed to introduce the problem 
  25. of molecular sequence alignment, while the workshop will focus on new 
  26. algorithmic techniques for this fundamental problem in computational 
  27. biology.  The tutorial and workshop will be free and open to the public.
  28. Graduate students and postdocs are especially encouraged to attend.
  29.  
  30. Thursday, Nov. 5: Tutorial
  31.  
  32.  
  33.        Topics to be covered include:
  34.             biological background, optimal pairwise alignments,
  35.             global and local alignment, suboptimal pairwise alignments,
  36.             distance vs. similarity, scoring matrices, database searching, 
  37.             and multiple alignment: trees and profiles.
  38.  
  39.  Instructor: Martin Vingron
  40.              Department of Mathematics
  41.              University of Southern California
  42.  
  43.  
  44. Friday, Nov. 6:  Workshop
  45.  
  46. Lectures: 
  47.  
  48.  
  49. "On Suboptimal Alignments of Biological Sequences" 
  50.         Dalit Naor
  51.         Department of Biochemistry
  52.         Stanford University
  53.  
  54. "Multiple Alignment with Guaranteed Error Bounds" 
  55.         Pavel Pevzner
  56.         Department of Computer Science
  57.         Pennsylvania State University
  58.  
  59. "Scoring Systems for Macromolecular Sequence Comparison"
  60.         Stephen Altschul
  61.         National Institute of Health
  62.  
  63. Title to be announced
  64.         John Kececioglu
  65.         Department of Computer Science
  66.         University of California at Davis
  67.  
  68.  
  69. "Analysis and Biological Evaluation of Parametric Sequence Alignments"
  70.         Martin Vingron
  71.         Department of Mathematics
  72.         University of Southern California
  73.  
  74.  
  75. "Dinucleotide Simple Sequence Repeats in Human DNA"
  76.         David Torney
  77.         Los Alamos National Laboratories
  78.  
  79. "3-D Profile Method and its Application in Protein Secondary Structure Prediction"
  80.         Kam Zhang
  81.         Molecular Biology Institute
  82.         University of California at Los Angeles
  83.  
  84.  
  85. For further information, please contact Tandy Warnow at (505) 845-7604
  86. or by email at twarnow@cs.sandia.gov.
  87.