home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / bionet / molbio / genbank / 649 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-25  |  1.2 KB
  1. Path: sparky!uunet!zaphod.mps.ohio-state.edu!caen!kuhub.cc.ukans.edu!husc-news.harvard.edu!husc.harvard.edu!robison1
  2. Newsgroups: bionet.molbio.genbank
  3. Subject: A continuing mis-use of misc_feature?
  4. Message-ID: <robison1.727979225@husc.harvard.edu>
  5. From: robison1@husc10.harvard.edu (Keith Robison)
  6. Date: 25 Jan 93 16:27:05 GMT
  7. Keywords: misc_feature, annotation, CDS
  8. Nntp-Posting-Host: husc10.harvard.edu
  9. Lines: 25
  10.  
  11. During a current project I have discovered that there are a lot of
  12. features with keys such as:
  13.  
  14.     misc_feature    694..1296
  15.                      /note="This feature applies to a gene which lacks a coding
  16.                      region feature."
  17.  
  18.  
  19. These notes are MEANINGLESS!!!!
  20. I have seen these applied to everything from KNOWN CDS's to transcriptional
  21. terminators.  It's bad enough that misc_feature is being mis-used, but
  22. why junk up the database with such a useless /note?  The consistent
  23. wording obviously means it's boilerplate inserted (semi?)automatically.
  24.  
  25. If there's nothing to say about a gene, why can't we just say nothing?
  26.  
  27.  
  28. Keith Robison
  29. Harvard University
  30. Department of Cellular & Developmental Biology
  31. Department of Genetics / HHMI
  32.  
  33. robison@biosun.harvard.edu 
  34.  
  35.  
  36.