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/ NetNews Usenet Archive 1993 #1 / NN_1993_1.iso / spool / bionet / software / 2384 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-07  |  4.1 KB
  1. Path: sparky!uunet!zaphod.mps.ohio-state.edu!howland.reston.ans.net!wupost!spool.mu.edu!hri.com!enterpoop.mit.edu!biosci!daresbury!daresbury!news
  2. From: wastec@unpsun1.cc.unp.ac.za (Centre For Waste Technology)
  3. Newsgroups: bionet.software
  4. Subject: RE: INFORMATION ON MSc PROJECT
  5. Message-ID: <1993Jan7.130950.27713@gserv1.dl.ac.uk>
  6. Date: 7 Jan 93 13:09:49 GMT
  7. Sender: list-admin@daresbury.ac.uk
  8. Distribution: bionet
  9. Lines: 91
  10. Original-To: bio-soft@uk.ac.daresbury
  11. Original-Cc: wastec@ZA.AC.UND.CC.Bertha
  12. X-Mailer: ELM [version 2.3 PL11]
  13.  
  14.  
  15.  
  16. Hello Great Wide World,
  17.  
  18. REQUEST FOR INFORMATION ON IMAGE ANALYSIS AND BIOFILM FORMATION.
  19.  
  20. Below is a summary of what I am doing for my
  21. "MASTERS OF THE UNIVERSE and other small and insignificant
  22. things......" theis. 
  23.  
  24. If anyone has any information they think could help me I would really
  25. appreciate it.  Thank you in advance.
  26.  
  27.       To date, possibly due to methodological difficulties, no
  28. definitive studies of the role of surfaces in soil have been
  29. reported despite the fact that knowledge of this is central to
  30. the understanding of the importance of microorganisms to, for
  31. example, revegetation of landfill sites or in bioremediation.
  32.  
  33.      The central aim of this project is to establish
  34. methodologies appropriate for definitive fundamental studies in
  35. microecophsiology.  Development of sampling techniques,
  36. microscopy and image analysis hardware and software, to determine
  37. the behaviour of both planktonic and surface-attached (biofilm
  38. forming) microorganisms in microecophysiological terms is central
  39. to the study.  The first step is to establish methods for
  40. studying the "real time" processes (of both individual microbial
  41. and associations) of attachment, establishment, division and
  42. growth on surfaces in situ, under constant, standardised
  43. conditions.  The second step will be to modify these methods for
  44. the study of microbial associations in situ.
  45.  
  46.      These methods will then be used to investigate the effects
  47. of landfill leachate on soil during vertical migration and the
  48. bioremediation of contaminated soil, which are two on-going
  49. research programmes in the International Centre for Waste
  50. Technology (Africa), University of Natal, Pietermaritzburg. 
  51. Preliminary work has shown that two distinct microbial
  52. populations, growth rate independent (surface-attached) and
  53. growth rate dependent (planktonic) are significantly involved in
  54. the processes.  Unfortunately, at present, there is no direct
  55. method available to determine the rate of growth and significance
  56. of the former population type and, thus, research progress has
  57. been restricted.
  58.  
  59.      In order to reduce the considerable number of variables that
  60. influence growth on surfaces, single associations will be used,
  61. growing in defined, controlled conditions of continuous culture
  62. microscopy units (CCMU) which are housed in a controlled
  63. environment incubator which has sections for anaerobic and
  64. aerobic environments.  The strictly controlled environmental
  65. variables are temperature (30oC), substrate concentration, flow
  66. rate, pH, light intensity and oxygen partial pressure.  The plan
  67. is to set-up the CCMU, prior to inoculation and, subsequently,
  68. monitoring of the growth of the associations.
  69.  
  70.      The analytical system consists of a microscope attached to a
  71. video camera which allows images of selected microorganisms to be
  72. stored for later analysis on a Vidas (Kontron) digital image
  73. analysis system.  Images of morphologically distinguished
  74. microorganisms can be measured at preselected times and the
  75. values obtained used to accurately determine the growth rates of
  76. the species.
  77.  
  78.      Any suggestions on the topics I have mentioned would be greatly
  79.      appreciated, no matter insignificant they might seem.
  80.  
  81. Thanx in advance.
  82.  
  83. Yours sincerely
  84. Barry Dudley
  85.  
  86. #############################################################
  87.  
  88. BARRY DUDLEY
  89. THE MASTERS OF THE UNIVERSE AND OTHER SMALL AND INSIGNIFICANT
  90. THINGS.......................................................
  91. International Centre for Waste Technology
  92. Department of Microbiology and Plant Pathology
  93. University of Natal
  94. PO Box 375
  95. Pietermaritzburg
  96. 3200
  97. South Africa
  98. Email wastec@unpsun1.cc.unp.ac.za
  99.  
  100. ############################################################
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