home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #27 / NN_1992_27.iso / spool / sci / bio / technolo / 328 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1992-11-21  |  1.1 KB  |  26 lines
  1. Newsgroups: sci.bio.technology
  2. Path: sparky!uunet!think.com!spool.mu.edu!umn.edu!molbio.cbs.umn.edu!eschen
  3. From: eschen@molbio.cbs.umn.edu (Art Eschenlauer)
  4. Subject: Help: GC-rich PCR?
  5. Message-ID: <1992Nov22.053232.17997@news2.cis.umn.edu>
  6. Summary: I need help with getting a GC-rich region to amplify!
  7. Keywords: PCR, Polymerase Chain Reaction
  8. Sender: news@news2.cis.umn.edu (Usenet News Administration)
  9. Nntp-Posting-Host: molbio.cbs.umn.edu
  10. Organization: University of Minnesota
  11. X-Newsreader: Tin 1.1 PL5
  12. Date: Sun, 22 Nov 1992 05:32:32 GMT
  13. Lines: 11
  14.  
  15. Has anyone out there much experience with doing PCR on GC-rich
  16. DNA? I am having a devilishly difficult time of it. I'm trying
  17. to amplify three genes from a 68% G+C region from Alcaligenes
  18. eutrophus and none of the six primer pairs that I have tried
  19. have given me even fair accumulation of amplified product.
  20. Even 10% formamide and a 4 minute 100 degree C denaturation
  21. (with Vent, a more stable polymerase than Taq) did not work.
  22. I've extensively analyzed my primers, but I do not see how
  23. they could be the problem in all six cases.
  24.   An emailed response to eschen@molbio.cbs.umn.edu would be
  25. appreciated. Thanks. -Art
  26.