home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #27 / NN_1992_27.iso / spool / bionet / infothe / 978 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1992-11-15  |  2.5 KB  |  62 lines
  1. Newsgroups: bionet.info-theory
  2. Path: sparky!uunet!stanford.edu!ames!haven.umd.edu!darwin.sura.net!fconvx.ncifcrf.gov!fcs260c2!toms
  3. From: toms@fcs260c2.ncifcrf.gov (Tom Schneider)
  4. Subject: Re: What is a "perfect" crystal?
  5. Message-ID: <BxsBHq.364@ncifcrf.gov>
  6. Summary: OK folks - check this out!  MOLECULAR PENNIES!
  7. Keywords: X-ray_Diffraction Single_Crystals Disorder Twinning Entropy
  8. Sender: usenet@ncifcrf.gov (C News)
  9. Nntp-Posting-Host: fcs260c2.ncifcrf.gov
  10. Organization: Frederick Cancer Research and Development Center
  11. References: <1992Nov15.210817.20886@umbc3.umbc.edu>
  12. Date: Mon, 16 Nov 1992 01:15:26 GMT
  13. Lines: 47
  14.  
  15. In article <1992Nov15.210817.20886@umbc3.umbc.edu>
  16. hybl@umbc4.umbc.edu (Dr. Albert Hybl (UMAB-BIOPHYS)) writes:
  17.  
  18. >  You should add some FAT to you chowder, after all, every living cell
  19. >contains some lipids.  I intended this to be an example for
  20. >something being discused--I forgot what.  Oh, well--just toss
  21. >it into chowder pot.
  22. > 
  23. >>
  24. >>      CH2OR               CH2OR          (below plane)
  25. >>      .                   .
  26. >>      .                   .
  27. >>   HO-C-H     and       H-C-OH
  28. >>      .                   .
  29. >>      .                   .
  30. >>      CH2OR               CH2OR          (below plane)
  31. >>  (a)                 (b)
  32. >
  33. >                   O  H   H
  34. >             R =  -C-(C)9-C-Br
  35. >                      H   H
  36. >>
  37. >>The disorder results from the competitive occupancy for each
  38. >>site by rotational isomers (a) and (b). 
  39.  
  40. Ok (not 0K! :-) now it makes sense - Perhaps you brought this up as a nice
  41. example of the penny analogy.  If I take 100 pennies and throw them down on a
  42. table, after they have stopped bouncing around - that is, after they have
  43. "cooled" - some will be heads and others will be tails.  As in your example,
  44. the orientation doesn't matter, and does not have long range effects.  Because
  45. there are two equally likely orientations of the molecules, uncertainty of the
  46. orientation of each molecule is log 2(2) = 1 bit.  You expressed this as "1.38
  47. cal/mole degree", which is the same thing (a trivial derivation is in
  48. Schneider.edmm).
  49.  
  50. In other words, it's a perfect example of molecular pennies!
  51.  
  52. This example is also neat because it relates to the OK problem.  Could we cool
  53. this "twinned" crystal to 0K?  Your results imply that the position of the
  54. oxygen has no energetic implication.  Yet one could store 1 bit of information
  55. in each of the molecules!  What is a "perfect" crystal?
  56.  
  57.   Tom Schneider
  58.   National Cancer Institute
  59.   Laboratory of Mathematical Biology
  60.   Frederick, Maryland  21702-1201
  61.   toms@ncifcrf.gov
  62.