Det har gjorts ett flertal större utgrävningar på området för det medeltida Åbo. Under 1995 gjordes utgrävningar på ett stort område i det s.k. klosterkvarteret, ung. 250 m nedströms från domkyrkan, invid Aura å. Vid utgrävningarna fann man en del av ett kvarter som under medeltiden omfattade flera stenbyggnader och gator. Stenbyggnaderna var byggda senast i början på 1400-talet, ovanpå tidigare bosättning och äldre kulturlager. Stenbyggnaderna med källare var välbevarade och runt dem byggdes museet Aboa Vetus. Vid utgrävningarna tillvaratogs betydande mängder fynd från 1800-talet bakåt till sekelskiftet mellan 1200-talet och 1300-talet.
