home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ bioinformatics.org / bioinformatics.org_software.tar / www.bioinformatics.org / download / gipsy / GIPSy.jar / blosum80.txt < prev    next >
Text File  |  2012-11-30  |  2KB  |  32 lines
  1. #  Matrix made by matblas from blosum80_3.iij
  2. #  * column uses minimum score
  3. #  BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/3 Bit Units
  4. #  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
  5. #  Cluster Percentage: >= 80
  6. #  Entropy =   0.9868, Expected =  -0.7442
  7.    A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
  8. A  7 -3 -3 -3 -1 -2 -2  0 -3 -3 -3 -1 -2 -4 -1  2  0 -5 -4 -1 -3 -2 -1 -8 
  9. R -3  9 -1 -3 -6  1 -1 -4  0 -5 -4  3 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 -2  0 -2 -8 
  10. N -3 -1  9  2 -5  0 -1 -1  1 -6 -6  0 -4 -6 -4  1  0 -7 -4 -5  5 -1 -2 -8 
  11. D -3 -3  2 10 -7 -1  2 -3 -2 -7 -7 -2 -6 -6 -3 -1 -2 -8 -6 -6  6  1 -3 -8 
  12. C -1 -6 -5 -7 13 -5 -7 -6 -7 -2 -3 -6 -3 -4 -6 -2 -2 -5 -5 -2 -6 -7 -4 -8 
  13. Q -2  1  0 -1 -5  9  3 -4  1 -5 -4  2 -1 -5 -3 -1 -1 -4 -3 -4 -1  5 -2 -8 
  14. E -2 -1 -1  2 -7  3  8 -4  0 -6 -6  1 -4 -6 -2 -1 -2 -6 -5 -4  1  6 -2 -8 
  15. G  0 -4 -1 -3 -6 -4 -4  9 -4 -7 -7 -3 -5 -6 -5 -1 -3 -6 -6 -6 -2 -4 -3 -8 
  16. H -3  0  1 -2 -7  1  0 -4 12 -6 -5 -1 -4 -2 -4 -2 -3 -4  3 -5 -1  0 -2 -8 
  17. I -3 -5 -6 -7 -2 -5 -6 -7 -6  7  2 -5  2 -1 -5 -4 -2 -5 -3  4 -6 -6 -2 -8 
  18. L -3 -4 -6 -7 -3 -4 -6 -7 -5  2  6 -4  3  0 -5 -4 -3 -4 -2  1 -7 -5 -2 -8 
  19. K -1  3  0 -2 -6  2  1 -3 -1 -5 -4  8 -3 -5 -2 -1 -1 -6 -4 -4 -1  1 -2 -8 
  20. M -2 -3 -4 -6 -3 -1 -4 -5 -4  2  3 -3  9  0 -4 -3 -1 -3 -3  1 -5 -3 -2 -8 
  21. F -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -2 -1  0 -5  0 10 -6 -4 -4  0  4 -2 -6 -6 -3 -8 
  22. P -1 -3 -4 -3 -6 -3 -2 -5 -4 -5 -5 -2 -4 -6 12 -2 -3 -7 -6 -4 -4 -2 -3 -8 
  23. S  2 -2  1 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -2  7  2 -6 -3 -3  0 -1 -1 -8 
  24. T  0 -2  0 -2 -2 -1 -2 -3 -3 -2 -3 -1 -1 -4 -3  2  8 -5 -3  0 -1 -2 -1 -8 
  25. W -5 -5 -7 -8 -5 -4 -6 -6 -4 -5 -4 -6 -3  0 -7 -6 -5 16  3 -5 -8 -5 -5 -8 
  26. Y -4 -4 -4 -6 -5 -3 -5 -6  3 -3 -2 -4 -3  4 -6 -3 -3  3 11 -3 -5 -4 -3 -8 
  27. V -1 -4 -5 -6 -2 -4 -4 -6 -5  4  1 -4  1 -2 -4 -3  0 -5 -3  7 -6 -4 -2 -8 
  28. B -3 -2  5  6 -6 -1  1 -2 -1 -6 -7 -1 -5 -6 -4  0 -1 -8 -5 -6  6  0 -3 -8 
  29. Z -2  0 -1  1 -7  5  6 -4  0 -6 -5  1 -3 -6 -2 -1 -2 -5 -4 -4  0  6 -1 -8 
  30. X -1 -2 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -1 -1 -5 -3 -2 -3 -1 -2 -8 
  31. * -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8 -8  1 
  32.