home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Education Sampler 1992 [NeXTSTEP] / Education_1992_Sampler.iso / Chemistry / Midas / Demos / crodna / crodna.ses < prev    next >
Text File  |  1992-08-19  |  3KB  |  171 lines
  1. m+version 1
  2. stereo
  3. end
  4. var
  5.     char_cursor_color "24" "24"
  6.     char_italics_color "48" "48"
  7.     char_bold_color "8" "8"
  8.     char_color "43" "43"
  9.     bg_intensity "0.25" "0.25"
  10.     bg_color "64" "64"
  11.     pair_scale "1.0" "1.0"
  12.     vpsep "42" "35"
  13.     eyesep "2" "2"
  14.     viewdist "30" "30"
  15.     linewidth "1" "1"
  16.     font "Courier12" "Courier12"
  17. end
  18. status
  19.     halfbond    off
  20.     cofg    off
  21.     independent    off
  22.     labels    on
  23.     record    on
  24.     ortho    off
  25.     text    off
  26.     verbose    on
  27.     control    off
  28.     sphere    on
  29.     showsphere    on
  30.     filenames    off
  31.     autocolor    on
  32.     fullscreen    off
  33. end
  34. gfx
  35.     cname gray 0.500 0.500 0.500
  36.     cname black 0.000 0.000 0.000
  37.     cname yellow 1.000 1.000 0.000
  38.     cname red 1.000 0.000 0.000
  39.     cname magenta 1.000 0.000 1.000
  40.     cname blue 0.000 0.000 1.000
  41.     cname cyan 0.000 1.000 1.000
  42.     cname green 0.000 1.000 0.000
  43.     cname white 1.000 1.000 1.000
  44. end
  45. frame
  46.     panel_state    "SideView"
  47. end
  48. atoms
  49.     vdw
  50.         extend    0.000
  51.         density    1.000
  52.         radius    9 1.000 *
  53.         radius    8 1.000 *
  54.         radius    7 1.000 *
  55.         radius    6 1.000 *
  56.         radius    5 1.000 *
  57.         radius    4 1.000 *
  58.         radius    3 1.000 *
  59.         radius    2 1.000 *
  60.         radius    1 1.000 *
  61.         radius    0 1.000 *
  62.         radius    H 1.000 *
  63.         radius    BR 1.950 *
  64.         radius    ZN 1.380 *
  65.         radius    CU 1.280 *
  66.         radius    FE 0.640 *
  67.         radius    CL 1.800 *
  68.         radius    B 1.800 *
  69.         radius    I 2.150 *
  70.         radius    F 1.350 *
  71.         radius    P 1.900 *
  72.         radius    S 1.850 *
  73.         radius    O 1.500 *
  74.         radius    N 1.800 *
  75.         radius    C 1.800 *
  76.         radius    * 1.800 *
  77.     end
  78.     model
  79.         pdb 0 crodna.0
  80.         pdb 1 crodna.1
  81.     end
  82.     xform
  83.         name default
  84.             center    1.084 -11.719 0.300
  85.             extent    43.925
  86.             clip    44.224 -43.625
  87.             scale    1.500
  88.             select_all
  89.             bondrot    11 1.000
  90.             bondrot    12 1.000
  91.             models    2
  92.             model    0 on
  93.                 1.000 0.000 0.000 0.000
  94.                 0.000 1.000 0.000 0.000
  95.                 0.000 0.000 1.000 0.000
  96.                 0.000 0.000 0.000 1.000
  97.             model    1 on
  98.                 1.000 0.000 0.000 0.000
  99.                 0.000 1.000 0.000 0.000
  100.                 0.000 0.000 1.000 0.000
  101.                 0.000 0.000 0.000 1.000
  102.         end
  103.         stack
  104.             center    1.084 -11.719 0.300
  105.             extent    43.925
  106.             clip    44.224 -43.625
  107.             scale    1.500
  108.             select_all
  109.             bondrot    11 1.000
  110.             bondrot    12 1.000
  111.             models    2
  112.             model    0 on
  113.                 1.000 0.000 0.000 0.000
  114.                 0.000 1.000 0.000 0.000
  115.                 0.000 0.000 1.000 0.000
  116.                 0.000 0.000 0.000 1.000
  117.             model    1 on
  118.                 1.000 0.000 0.000 0.000
  119.                 0.000 1.000 0.000 0.000
  120.                 0.000 0.000 1.000 0.000
  121.                 0.000 0.000 0.000 1.000
  122.         end
  123.     end
  124. end
  125. psdev
  126.     "x-rot"    -1 0 0 0 0.000
  127.     "y-rot"    -1 0 0 0 0.000
  128.     "z-rot"    -1 0 0 0 0.000
  129.     "x-tran"    -1 0 0 0 0.000
  130.     "y-tran"    -1 0 0 0 0.000
  131.     "z-tran"    3 1 0 0 0.000
  132.     "scale"    2 1 0 0 0.000
  133.     "hither"    -1 0 0 0 0.000
  134.     "yon"    -1 0 0 0 0.000
  135.     "thickness"    2 1 0 0 0.000
  136.     "section"    1 1 0 0 0.000
  137.     "x-rock"    -1 0 0 0 0.000
  138.     "y-rock"    -1 0 0 0 0.000
  139.     "z-rock"    -1 0 0 0 0.000
  140.     "bondrot 0"    -1 0 0 0 0.000
  141.     "bondrot 1"    -1 0 0 0 0.000
  142.     "bondrot 2"    -1 0 0 0 0.000
  143.     "bondrot 3"    -1 0 0 0 0.000
  144.     "bondrot 4"    -1 0 0 0 0.000
  145.     "bondrot 5"    -1 0 0 0 0.000
  146.     "bondrot 6"    -1 0 0 0 0.000
  147.     "bondrot 7"    -1 0 0 0 0.000
  148.     "bondrot 8"    -1 0 0 0 0.000
  149.     "bondrot 9"    -1 0 0 0 0.000
  150.     "bondrot 10"    -1 0 0 0 0.000
  151.     "bondrot 11"    -1 0 0 0 0.000
  152.     "bondrot 12"    -1 0 0 0 0.000
  153.     "bondrot 13"    -1 0 0 0 0.000
  154.     "bondrot 14"    -1 0 0 0 0.000
  155.     "bondrot 15"    -1 0 0 0 0.000
  156. end
  157. alias
  158.     zone    "show z<"
  159.     neon    "preneon | /usr/local/bin/conic"
  160.     preneon    "pdbrun conect /usr/local/bin/neon"
  161.     ribbon    "pdbrun conect /usr/local/bin/cartoon"
  162.     conic    "pdbrun /usr/local/bin/conic"
  163.     close    "~open"
  164.     mainchain    "@ n,ca,c,o"
  165.     sidechain    "@ cb - *"
  166.     atom    "@"
  167.     residue    ":"
  168.     molecule    "#"
  169.     model    "#"
  170. end
  171.