La seconda fatica fu di uccidere l'Idra della plaude di Lerna. L'Idra era un mostro con il corpo di cane e molte teste che rinascevano ogni volta che venivano tagliate. A mano a mano che Eracle tagliava le teste con la spada suo nipote Iolao bruciava i colli per impedire che ricrescessero. Quando l'Idra fu morta Eracle tenne il veleno per le sue frecce. Euristeo non considerò valida questa fatica perchè Eracle era stato aiutato dal nipote.