home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ OS/2 Shareware BBS: 10 Tools / 10-Tools.zip / octa21fb.zip / octave / SCRIPTS.ZIP / scripts / statistics / tests / mcnemar_test.m < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1998-10-29  |  2.0 KB  |  65 lines
  1. ## Copyright (C) 1996, 1997  Kurt Hornik
  2. ## 
  3. ## This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  4. ## it under the terms of the GNU General Public License as published by
  5. ## the Free Software Foundation; either version 2, or (at your option)
  6. ## any later version.
  7. ## 
  8. ## This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  9. ## WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10. ## MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11. ## General Public License for more details. 
  12. ## 
  13. ## You should have received a copy of the GNU General Public License
  14. ## along with this file.  If not, write to the Free Software Foundation,
  15. ## 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA.
  16.  
  17. ## usage:  [pval, chisq, df] = mcnemar_test (x)
  18. ##
  19. ## For a square contingency table x of data cross-classified on the row
  20. ## and column variables, McNemar's test can be used for testing the null
  21. ## hypothesis of symmetry of the classification probabilities.
  22. ##
  23. ## Under the null, chisq is approximately distributed as chisquare with
  24. ## df degrees of freedom, and pval is the p-value (1 minus the CDF of
  25. ## this distribution at chisq) of the test.
  26. ##
  27. ## If no output argument is given, the p-value of the test is displayed.
  28.   
  29. ## Author:  KH <Kurt.Hornik@ci.tuwien.ac.at>
  30. ## Description:  McNemar's test for symmetry
  31.   
  32. function [pval, chisq, df] = mcnemar_test (x)
  33.   
  34.   if (nargin != 1)
  35.     usage ("mcnemar_test (x)");
  36.   endif
  37.   
  38.   if (! (min (size (x)) > 1) && is_square (x))
  39.     error (strcat ("mcnemar_test:  ",
  40.            "x must be a square matrix of size > 1."));
  41.   elseif (! (all (all (x >= 0)) && all (all (x == round (x)))))
  42.     error (strcat ("mcnemar_test:  ",
  43.            "all entries of x must be nonnegative integers."));
  44.   endif
  45.   
  46.   r = rows (x);
  47.   df = r * (r - 1) / 2;
  48.   if (r == 2)
  49.     num = max (abs (x - x') - 1, 0) .^ 2;
  50.   else
  51.     num = abs (x - x') .^ 2;
  52.   endif
  53.   
  54.   chisq = sum (sum (triu (num ./ (x + x'), 1)));
  55.   pval = 1 - chisquare_cdf (chisq, df);
  56.   
  57.   if (nargout == 0)
  58.     printf ("  pval:  %g\n", pval);
  59.   endif
  60.   
  61. endfunction
  62.   
  63.  
  64.  
  65.