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/ Mac-Source 1994 July / Mac-Source_July_1994.iso / Pascal / source / Dotty Folder / blueksm.seq < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1989-05-07  |  6.3 KB  |  195 lines  |  [TEXT/.Plt]
  1. BlueScribe KS Minus - Cloning vector
  2. ENTRY BLUEKSM                  #TYPE DNA CIRCULAR
  3. TITLE BlueScribe KS Minus - Cloning vector
  4. DATE    28-JAN-1987
  5.    #sequence  02-FEB-1987
  6.    #sequence  04-MAR-1987
  7.    #sequence  03-APR-1987
  8. ACCESSION VB0077
  9. SOURCE    artificial
  10. REFERENCE
  11.    #number 1
  12.    #authors Fernandez J.M., Short J.M., Renshaw M., Huse W., Sorge J.
  13.    #journal Gene (1987) in press
  14.    #citation Sequence data from StrataGene
  15.    #comment  sequence correction according to Stratagene
  16. COMMENT
  17.    Obtained from StrataGene on floppy disc.
  18.    Revised 02-FEB-1987 by F. Pfeiffer:
  19.    1409/10 "AT" to "TA" to match revised sequence of PBR322
  20.    Revised 4-MAR-1987 to match sequence of pUC19 on request
  21.    of Stratagene
  22.    Polylinker region revised 03-APR-1987 according to Stratagene
  23. COMMENT
  24.    The stand shown corresponds to pUC19c.
  25.    As in the published sequence of pUC19c, The M13mp19 lacZ region
  26.    is on the complementary strand.
  27. COMMENT
  28.    This vector contains the f1 origin so that the minus strand
  29.    can be obtained upon f1 superinfection.
  30. KEYWORDS
  31. CROSSREFERENCE
  32.    #parent
  33.      VecBase(3):BlueM13m
  34.    #parent
  35.      VecBase(3):pUC19, VecSource(3):PromT7, VecSource(3):PromT3,
  36.      VecSource(3):bGalKS, GenBank(50):PF1
  37.    #brother
  38.      VecBase(3):BlueKSp, VecBase(3):BlueSKm
  39. PARENT
  40.    Features of BlueKSm (2964 bp)
  41.      residue     source
  42.       3- 458  5488-5943     phage f1
  43.     460- 624   236- 400     pUC19c
  44.     626- 645     1-  20     T7 promoter
  45.     653- 760   108-   1 (c) BlueKS-polylinker
  46.     772- 791    20-   1 (c) T3 promoter
  47.     795-2964   448-2617     pUC19c
  48.    Conflict (cfl) and Mutations (mut): none
  49. PARENT
  50.    Features of BlueKSm (2964 bp)
  51.      residue     source
  52.       3- 458  5488-5943     phage f1
  53.     460- 624   449- 285 (c) pUC19
  54.     626- 645     1-  20     T7 promoter
  55.     653- 760   108-   1 (c) BlueKS-polylinker
  56.     772- 791    20-   1 (c) T3 promoter
  57.     795-1031   237-   1 (c) pUC19
  58.    1032-2964  2686- 754 (c) pUC19
  59.    Conflict (cfl) and Mutations (mut): none
  60. FEATURE
  61.          643           start of T7-RNA synthesis
  62.          774       (c) start of T3-RNA synthesis
  63.    1976-2764 789-1 (c) Ap-R; b-lactamase
  64. POLYLINKER
  65.      KpnI-DraII-ApaI-XhoI-SalI-ClaI-HindIII-EcoRV-EcoRI-PstI-
  66.      SmaI-BamHI-SpeI-XbaI-NotI-XmaIII-BstXI-SacII-SacI
  67. SELECTION
  68.    #resistance  Ap
  69.    #indicator beta-galactosidase
  70. SUMMARY  BlueKSm    #length 2964   #checksum 1589
  71. SEQUENCE
  72.  
  73.    VECBASE:BLUEKSM  Length: 2964  May 7, 1989  20:09  Check: 1589  ..
  74.  
  75.        1  GGACGCGCCC TGTAGCGGCG CATTAAGCGC GGCGGGTGTG GTGGTTACGC 
  76.  
  77.       51  GCAGCGTGAC CGCTACACTT GCCAGCGCCC TAGCGCCCGC TCCTTTCGCT 
  78.  
  79.      101  TTCTTCCCTT CCTTTCTCGC CACGTTCGCC GGCTTTCCCC GTCAAGCTCT 
  80.  
  81.      151  AAATCGGGGG CTCCCTTTAG GGTTCCGATT TAGTGCTTTA CGGCACCTCG 
  82.  
  83.      201  ACCCCAAAAA ACTTGATTAG GGTGATGGTT CACGTAGTGG GCCATCGCCC 
  84.  
  85.      251  TGATAGACGG TTTTTCGCCC TTTGACGTTG GAGTCCACGT TCTTTAATAG 
  86.  
  87.      301  TGGACTCTTG TTCCAAACTG GAACAACACT CAACCCTATC TCGGTCTATT 
  88.  
  89.      351  CTTTTGATTT ATAAGGGATT TTGCCGATTT CGGCCTATTG GTTAAAAAAT 
  90.  
  91.      401  GAGCTGATTT AACAAAAATT TAACGCGAAT TTTAACAAAA TATTAACGTT 
  92.  
  93.      451  TACAATTTCG CGCCATTCGC CATTCAGGCT GCGCAACTGT TGGGAAGGGC 
  94.  
  95.      501  GATCGGTGCG GGCCTCTTCG CTATTACGCC AGCTGGCGAA AGGGGGATGT 
  96.  
  97.      551  GCTGCAAGGC GATTAAGTTG GGTAACGCCA GGGTTTTCCC AGTCACGACG 
  98.  
  99.      601  TTGTAAAACG ACGGCCAGTG AATTGTAATA CGACTCACTA TAGGGCGAAT 
  100.  
  101.      651  TGGAGCTCCA CCGCGGTGGC GGCCGCTCTA GAACTAGTGG ATCCCCCGGG 
  102.  
  103.      701  CTGCAGGAAT TCGATATCAA GCTTATCGAT ACCGTCGACC TCGAGGGGGG 
  104.  
  105.      751  GCCCGGTACC CAGCTTTTGT TCCCTTTAGT GAGGGTTAAT TCCGAGCTTG 
  106.  
  107.      801  GCGTAATCAT GGTCATAGCT GTTTCCTGTG TGAAATTGTT ATCCGCTCAC 
  108.  
  109.      851  AATTCCACAC AACATACGAG CCGGAAGCAT AAAGTGTAAA GCCTGGGGTG 
  110.  
  111.      901  CCTAATGAGT GAGCTAACTC ACATTAATTG CGTTGCGCTC ACTGCCCGCT 
  112.  
  113.      951  TTCCAGTCGG GAAACCTGTC GTGCCAGCTG CATTAATGAA TCGGCCAACG 
  114.  
  115.     1001  CGCGGGGAGA GGCGGTTTGC GTATTGGGCG CTCTTCCGCT TCCTCGCTCA 
  116.  
  117.     1051  CTGACTCGCT GCGCTCGGTC GTTCGGCTGC GGCGAGCGGT ATCAGCTCAC 
  118.  
  119.     1101  TCAAAGGCGG TAATACGGTT ATCCACAGAA TCAGGGGATA ACGCAGGAAA 
  120.  
  121.     1151  GAACATGTGA GCAAAAGGCC AGCAAAAGGC CAGGAACCGT AAAAAGGCCG 
  122.  
  123.     1201  CGTTGCTGGC GTTTTTCCAT AGGCTCCGCC CCCCTGACGA GCATCACAAA 
  124.  
  125.     1251  AATCGACGCT CAAGTCAGAG GTGGCGAAAC CCGACAGGAC TATAAAGATA 
  126.  
  127.     1301  CCAGGCGTTT CCCCCTGGAA GCTCCCTCGT GCGCTCTCCT GTTCCGACCC 
  128.  
  129.     1351  TGCCGCTTAC CGGATACCTG TCCGCCTTTC TCCCTTCGGG AAGCGTGGCG 
  130.  
  131.     1401  CTTTCTCATA GCTCACGCTG TAGGTATCTC AGTTCGGTGT AGGTCGTTCG 
  132.  
  133.     1451  CTCCAAGCTG GGCTGTGTGC ACGAACCCCC CGTTCAGCCC GACCGCTGCG 
  134.  
  135.     1501  CCTTATCCGG TAACTATCGT CTTGAGTCCA ACCCGGTAAG ACACGACTTA 
  136.  
  137.     1551  TCGCCACTGG CAGCAGCCAC TGGTAACAGG ATTAGCAGAG CGAGGTATGT 
  138.  
  139.     1601  AGGCGGTGCT ACAGAGTTCT TGAAGTGGTG GCCTAACTAC GGCTACACTA 
  140.  
  141.     1651  GAAGGACAGT ATTTGGTATC TGCGCTCTGC TGAAGCCAGT TACCTTCGGA 
  142.  
  143.     1701  AAAAGAGTTG GTAGCTCTTG ATCCGGCAAA CAAACCACCG CTGGTAGCGG 
  144.  
  145.     1751  TGGTTTTTTT GTTTGCAAGC AGCAGATTAC GCGCAGAAAA AAAGGATCTC 
  146.  
  147.     1801  AAGAAGATCC TTTGATCTTT TCTACGGGGT CTGACGCTCA GTGGAACGAA 
  148.  
  149.     1851  AACTCACGTT AAGGGATTTT GGTCATGAGA TTATCAAAAA GGATCTTCAC 
  150.  
  151.     1901  CTAGATCCTT TTAAATTAAA AATGAAGTTT TAAATCAATC TAAAGTATAT 
  152.  
  153.     1951  ATGAGTAAAC TTGGTCTGAC AGTTACCAAT GCTTAATCAG TGAGGCACCT 
  154.  
  155.     2001  ATCTCAGCGA TCTGTCTATT TCGTTCATCC ATAGTTGCCT GACTCCCCGT 
  156.  
  157.     2051  CGTGTAGATA ACTACGATAC GGGAGGGCTT ACCATCTGGC CCCAGTGCTG 
  158.  
  159.     2101  CAATGATACC GCGAGACCCA CGCTCACCGG CTCCAGATTT ATCAGCAATA 
  160.  
  161.     2151  AACCAGCCAG CCGGAAGGGC CGAGCGCAGA AGTGGTCCTG CAACTTTATC 
  162.  
  163.     2201  CGCCTCCATC CAGTCTATTA ATTGTTGCCG GGAAGCTAGA GTAAGTAGTT 
  164.  
  165.     2251  CGCCAGTTAA TAGTTTGCGC AACGTTGTTG CCATTGCTAC AGGCATCGTG 
  166.  
  167.     2301  GTGTCACGCT CGTCGTTTGG TATGGCTTCA TTCAGCTCCG GTTCCCAACG 
  168.  
  169.     2351  ATCAAGGCGA GTTACATGAT CCCCCATGTT GTGCAAAAAA GCGGTTAGCT 
  170.  
  171.     2401  CCTTCGGTCC TCCGATCGTT GTCAGAAGTA AGTTGGCCGC AGTGTTATCA 
  172.  
  173.     2451  CTCATGGTTA TGGCAGCACT GCATAATTCT CTTACTGTCA TGCCATCCGT 
  174.  
  175.     2501  AAGATGCTTT TCTGTGACTG GTGAGTACTC AACCAAGTCA TTCTGAGAAT 
  176.  
  177.     2551  AGTGTATGCG GCGACCGAGT TGCTCTTGCC CGGCGTCAAT ACGGGATAAT 
  178.  
  179.     2601  ACCGCGCCAC ATAGCAGAAC TTTAAAAGTG CTCATCATTG GAAAACGTTC 
  180.  
  181.     2651  TTCGGGGCGA AAACTCTCAA GGATCTTACC GCTGTTGAGA TCCAGTTCGA 
  182.  
  183.     2701  TGTAACCCAC TCGTGCACCC AACTGATCTT CAGCATCTTT TACTTTCACC 
  184.  
  185.     2751  AGCGTTTCTG GGTGAGCAAA AACAGGAAGG CAAAATGCCG CAAAAAAGGG 
  186.  
  187.     2801  AATAAGGGCG ACACGGAAAT GTTGAATACT CATACTCTTC CTTTTTCAAT 
  188.  
  189.     2851  ATTATTGAAG CATTTATCAG GGTTATTGTC TCATGAGCGG ATACATATTT 
  190.  
  191.     2901  GAATGTATTT AGAAAAATAA ACAAATAGGG GTTCCGCGCA CATTTCCCCG 
  192.  
  193.     2951  AAAAGTGCCA CCTG
  194.  
  195.