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Text File  |  1994-04-12  |  4KB  |  100 lines
  1. Animations
  2. ==========
  3.  
  4. This directory contains animations created by Jon Maber and
  5. Andrew Booth for BioNet TLTP.  They are mostly used as visual 
  6. aids in introductory Biochemistry lectures in the Dept. of 
  7. Biochemistry and Molecular Biology at the University of Leeds.
  8.  
  9.  
  10. Jon Maber
  11.  
  12.  
  13.  
  14. Here is a description of each;
  15.  
  16. Video for Windows Files
  17. =======================
  18.  
  19. CHR-BOAT.AVI    Space filling model of glucose flipping between
  20.                 chair and boat forms.
  21.  
  22. GLYCOLYS.AVI    Overview of glycolysis - space filling molecules
  23.                 tumble across screen.  Glucose cross fades into
  24.         Glyceraldhyde which cross fades into Lactate.
  25.                 Emphasises two processes in the pathway; splitting
  26.         of glucose and the shift of a hydroxyl group.
  27.  
  28. MEMB1.AVI       Cartoon showing membrane transport protein.  Shows
  29.                 'rocking' subunits.
  30.  
  31. MEMB2.AVI       Cartoon showing membrane transport protein.  Shows
  32.                 discredited model of protein rotating in the bilayer
  33.                 with ligand attached.
  34.  
  35. MEMB3.AVI       Cartoon showing membrane transport protein.  Shows
  36.                 valinomycin like transporter dissolved in lipid part
  37.                 of membrane.
  38.  
  39. MEMB4.AVI       Zoomed in version of MEMB3.AVI
  40.  
  41. MEMB5.AVI    Cartoon shows pore indiscriminately allowing small
  42.                 objects through membrane.
  43.  
  44. MEMB6.AVI       Close up of centre of ion channel.  Shows ion loosing
  45.                 solvation water and passing through channel.  Showes
  46.                 different coloured ion being repelled and not passing
  47.                 though.  Shows a drug molecule binding to channel.
  48.  
  49. MUTAROT1.AVI    Space filling model of glucose undergoing mutarotation.
  50.  
  51. MUTAROT2.AVI    Simple stick version of mutarotation is synchronised to
  52.                 MUTAROT1.AVI.
  53.  
  54. OPTICAL.AVI     Illustrates concept of stereoisomers with reference to
  55.                 biological systems.  Space filling models of L and D
  56.                 glyceraldehyde are shown with cartoon style binding sites.
  57.                 The molecules rotate and attempt to bind in three 
  58.                 orientations.  Then the molecules swap sides and attempt
  59.                 the same.
  60.                 This shows why enzymes are specific to one stereoisomer
  61.                 and hence why in general only one form of a metabolite
  62.                 is utilised.
  63.  
  64. PROJECTN.AVI    Illustrates the Fischer projection.  A space filling
  65.                 model of glyceraldehyde in the appropriate orientation
  66.                 flattens and cross fades to Fischer projection.  Helps
  67.                 get across a way of mentally picturing the real structure
  68.                 from the conventional projection.
  69.  
  70. Action! Files
  71. =============
  72.  
  73. ATPASE.ACT      Shows ATP synthesis by ATPase.  Doesn't show exact mechanism.
  74.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  75.  
  76. ETRANSP.ACT     Gives a simple overview of the electron transport chain in
  77.                 the mitochondrial inner membrane.  Doesn't show exact mechanism.
  78.                 Red represents reduced and blue oxidised carriers.
  79.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  80.  
  81. OXPHOS.ACT      Gives an overview of oxidative phosphorylation.  Shows e transport
  82.                 chain, proton circuit and ATP synthesis simulateously.
  83.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  84.  
  85.  
  86.  
  87. From Andrew Booth's 2nd year Biochemistry Lectures
  88. --------------------------------------------------
  89.  
  90. AFFINITY.ACT    Illustrates the principal of affinity chromatography.
  91.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  92.  
  93. GELFILT.ACT     Illustrates the principal of gel filtration.
  94.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  95.  
  96. IONEXCH.ACT     Illustrates the principal of ion exchange chromatography.
  97.                 Intended to accompany a verbal explanation in a lecture.
  98.  
  99.  
  100.