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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  31 lines
  1. ********************************************************
  2. * Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family signatures *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. Two fungal enzymes which are involved in ergosterol biosynthesis and which act
  6. by reducing  double  bonds  in  precursors of ergosterol have been shown to be
  7. evolutionary related [1]. These enzymes are C-14 sterol reductase (gene ERG24)
  8. and C-24(28)  sterol reductase (gene ERG4 in budding yeast and sts1 in fission
  9. yeast). The  sequences  of  these  enzymes  are also highly related to that of
  10. chicken lamin  B  receptor, which is thought to anchor the lamina to the inner
  11. nuclear membrane.
  12.  
  13. These proteins  are  highly  hydrophobic  and  seem  to contain seven or eight
  14. transmembrane regions.  As  signature  patterns,  we  selected  two  conserved
  15. regions. The  first one is apparently located in a loop between the fourth and
  16. fifth transmembrane regions and the second is at the C-terminal section.
  17.  
  18. -Consensus pattern: G-x(2)-[LIVM]-Y-D-x-F-x-G-x(2)-L-N-P-R-x-G
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21.  
  22. -Consensus pattern: [LIVM](2)-H-R-x(2)-R-D-x(3)-C-[KR]-x-K-Y-G
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Last update: June 1994 / First entry.
  27.  
  28. [ 1] Lai M.H., Bard M., Pierson C.A., Alexander J.F., Goebl M., Carter G.T.,
  29.      Kirsch D.R.
  30.      Gene 140:41-49(1994).
  31.