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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  38 lines
  1. ********************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 3 active site *
  3. ********************************************
  4.  
  5. It has been shown [1,2] that the following  glycosyl hydrolases can be, on the
  6. basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Beta glucosidases (EC 3.2.1.21) from  the  fungi  Aspergillus wentii (A-3),
  9.    Hansenula anomala,  Kluyveromyces  fragilis,  Saccharomycopsis  fibuligera,
  10.    (BGL1 and BGL2), Schizophyllum commune, and Trichoderma reesei (BGL1).
  11.  - Beta glucosidases from  the  bacteria   Agrobacterium  tumefaciens  (Cbg1),
  12.    Butyrivibrio  fibrisolvens  (bglA),  Clostridium thermocellum  (bglB),  and
  13.    Ruminococcus albus.
  14.  - Escherichia coli hypothetical protein yohA.
  15.  
  16. One of the conserved regions in  these enzymes  is  centered  on  a  conserved
  17. aspartic acid  residue  which has been shown [3], in  Aspergillus wentii beta-
  18. glucosidase A3, to be implicated in the catalytic mechanism. We have used this
  19. region as a signature pattern.
  20.  
  21. -Consensus pattern: [EQ]-x(4)-G-[LIVMFY]-x-[LIVM]-[ST]-D-W-x-[AG]-x(12)-[DN]
  22.                     [The first D is the active site residue]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  24.  E.coli yohA.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  28.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  29.  
  30. -Last update: December 1992 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] Henrissat B.
  33.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  34. [ 2] Castle L.A., Smith K.D., Morris R.O.
  35.      J. Bacteriol. 174:1478-1486(1992).
  36. [ 3] Bause E., Legler G.
  37.      Biochim. Biophys. Acta 626:459-465(1980).
  38.