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Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  43 lines
  1. *******************************************
  2. * Plant lipid transfer proteins signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Plant cells contain proteins,  called lipid transfer  proteins  (LTP) [1,2,3],
  6. which are able to facilitate  the transfer of  phospholipids  and other lipids
  7. across membranes. These proteins, whose subcellular location is not yet known,
  8. could play a major role in membrane biogenesis by conveying phospholipids from
  9. their site of biosynthesis to membranes unable to form these lipids.
  10.  
  11. Plant LTP's are  proteins  of  about 9 Kd (90 amino acids) which contain eight
  12. conserved  cysteine residues  all  involved  in disulfide bridges, as shown in
  13. the following schematic representation.
  14.  
  15.                      +-----------------------+
  16.                      |    +------+           |
  17.                      |    |      |           |    ****************
  18.                     xCxxxxCxxxxxxCCxxxxxxxxCxCxxxxxxxxxxxCxxxxxxCxx
  19.                                   |        |             |      |
  20.                                   +--------|-------------+      |
  21.                                            +--------------------+
  22.  
  23. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  24. '*': position of the pattern.
  25.  
  26. -Consensus pattern: [LIVM]-P-x(2)-C-x-[LIVM]-x-[LIVM]-x-[LIVMFY]-x-[LIVM]-S-
  27.                     x(3)-[DN]-C-x(2)-[LIVM]
  28.                     [The two C's are involved in disulfide bonds]
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31.  
  32. -Note: some  of  these  proteins  were originally thought to be alpha-amylase/
  33.  protease inhibitors (PAPI).
  34.  
  35. -Last update: December 1992 / Text revised.
  36.  
  37. [ 1] Wirtz K.W.A.
  38.      Annu. Rev. Biochem. 60:73-99(1991).
  39. [ 2] Arondel V., Kader J.C.
  40.      Experientia 46:579-585(1990).
  41. [ 3] Ohlrogge J.B., Browse J., Somerville C.R.
  42.      Biochim. Biophys. Acta 1082:1-26(1991).
  43.