home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00501 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  887 b   |  24 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L29 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L29 is one of the proteins from the large ribosomal subunit.
  6. L29 belongs to a family  of ribosomal proteins which, on the basis of sequence
  7. similarities [1], groups:
  8.  
  9.  - Eubacterial L29.
  10.  - Archaebacterial L29.
  11.  - Mammalian and Caenorhabditis elegans L35.
  12.  
  13. L29 is a protein of 63 to 138 amino-acid residues.  As a signature pattern, we
  14. selected a conserved region located in the central section of L29.
  15.  
  16. -Consensus pattern: [GN]-x(3)-[KRNQ]-x(3)-[LIVMFY]-[KRS]-x-[LIVMFY]-[KR](2)-x-
  17.                     [LIVM]-A-R
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: June 1994 / Text revised.
  21.  
  22. [ 1] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K.
  23.      Protein Seq. Data Anal. 5:285-300(1993).
  24.