home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00488 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  37 lines
  1. *****************************************
  2. * Argininosuccinate synthase signatures *
  3. *****************************************
  4.  
  5. Argininosuccinate synthase (EC 6.3.4.5) (AS)  is  a   urea  cycle enzyme  that
  6. catalyzes the  penultimate  step  in  arginine biosynthesis: the ATP-dependent
  7. ligation of  citrulline    to  aspartate  to  form  argininosuccinate, AMP and
  8. pyrophosphate [1,2].
  9.  
  10. In humans,  a  defect  in  the AS gene causes citrullinemia, a genetic disease
  11. characterized by severe vomiting spells and mental retardation.
  12.  
  13. AS is  a  homotetrameric enzyme of chains of about 400 amino-acid residues. An
  14. arginine seems to be important for the enzyme's catalytic mechanism.
  15.  
  16. The sequences of AS  from various prokaryotes, archaebacteria  and  eukaryotes
  17. show significant similarity.  We  selected  two signature patterns for AS. The
  18. first is a highly conserved stretch of nine residues located in the N-terminal
  19. extremity of  these  enzymes,  the  second  is derived from a conserved region
  20. which contains one of the conserved arginine residues.
  21.  
  22. -Consensus pattern: A-[FY]-S-G-G-L-D-T-S
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Consensus pattern: G-x-T-x-K-G-N-D-x(2)-R-F
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  29.  
  30. -Last update: December 1991 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] van Vliet F., Crabeel M., Boyen A., Tricot C., Stalon V., Falmagne P.,
  33.      Nakamura Y., Baumberg S., Glansdorff N.
  34.      Gene 95:99-104(1990).
  35. [ 2] Morris C.J., Reeve J.N.
  36.      J. Bacteriol. 170:3125-3130(1988).
  37.