home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00265 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  31 lines
  1. ************************************************
  2. * Proliferating cell nuclear antigen signature *
  3. ************************************************
  4.  
  5. Proliferating cell  nuclear  antigen (PCNA) [1,2] is a protein involved in DNA
  6. replication  by  acting  as a    cofactor    for    DNA  polymerase delta, the
  7. polymerase responsible for leading strand DNA replication.
  8.  
  9. A similar protein exists  in  yeast (gene POL30) [3]  and is  associated  with
  10. polymerase III, the yeast analog of polymerase delta.   In  baculoviruses  the
  11. ETL protein has  been shown [4] to  be highly related  to PCNA and is probably
  12. associated with the viral encoded DNA polymerase.
  13.  
  14. As a  signature for this family  of proteins, we selected a  conserved  region
  15. located in the N-terminal section, which has been proposed to bind DNA.
  16.  
  17. -Consensus pattern: R-C-D-[RH]-x(3)-[LIVM]-x(3)-[LIVM]-x-[SAN]-[LIVM]-x-K-
  18.                     [LIVMF](2)-[RK]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  22.  
  23. [ 1] Bravo R., Frank R., Blundell P.A., McDonald-Bravo H.
  24.      Nature 326:515-517(1987).
  25. [ 2] Suzuka I., Hata S., Matsuoka M., Kosugi S., Hashimoto J.
  26.      Eur. J. Biochem. 195:571-575(1991).
  27. [ 3] Bauer G.A., Burgess P.M.J.
  28.      Nucleic Acids Res. 18:261-265(1990).
  29. [ 4] O'Reilly D.R., Crawford A.M., Miller L.K.
  30.      Nature 337:606-606(1989).
  31.