WinRoute může běžet na jednom systému s většinou běžných aplikací (včetně her apod.). Na tomtéž počítači však nemohou běžet aplikace používající stejné porty, tj. zejména SMTP / POP3 mailserver, DNS, DHCP a proxy server. Chcete-li zde některou z těchto aplikací provozovat, je třeba vypnout příslušný modul WinRoute.
Dále způsobují problémy zejména aplikace zasahující do síťového subsystému - proxy, firewally, ovladače zařízení apod. Uveďme alespoň několik nejrozšířenějších:
Bay Networks VPN klient (Nortel)
Přestože WinRoute podporuje protokol IPSec včetně implementace firmy Nortel, tento klient nemůže být provozován na jednom počítači společně s WinRoute. Klient musí být nainstalován na některý počítač ve vaší lokální síti.
Norton Antivirus
Používáte-li mailserver ve WinRoute, zakažte antivirovou kontrolu e-mailů. Jinak nebude mailserver fungovat správně. (Kontrola paměti a souborů na disku samozřejmě nevadí). Pro kontrolu příchozích e-mailů je v současné době možné použít pouze produkt Norton Antivirus for Internet E-mail Gateways (viz kapitola Speciální nastavení a příklady).
WinGate, MS Proxy serveru
Odinstalujte všechny komponenty těchto produktů (server i klienta) před instalací WinRoute.
WinProxy, MS Internet Connection Sharing (Sdílení Internetového připojení)
Oba tyto produkty používají nízkoúrovňové ovladače, které vykazují konflikt s ovladačem WinRoute.
Ovladače síťových karet
Používejte pokud možno standardní síťové karty renomovaných výrobců. Některé karty totiž mohou používat speciální instrukce a ovladač WinRoute pak nemůže s takovou kartou komunikovat. WinRoute se snaží podporovat co největší počet síťových karet, není ale možné testovat všechny modely všech výrobců. Zaznamenáte-li problémy s konkrétním typem síťové karty, můžete se obrátit na technickou podporu firmy TINY Software (viz http://www.tinysoftware.cz).
V každém případě se doporučuje nainstalovat nejnovější ovladače dané karty (zpravidla bývají k dispozici ke stažení na WWW stránkách příslušného výrobce).