Přirozený požadavek správce sítě je sledovat také objem dat přenesených elektronickou poštou (e-mailem) přijatou lokálním mailserverem. Problém však nastává v případě, že mailserver běží na počítači, který je zároveň branou do Internetu pro lokální síť - v takovém případě se totiž příslušné pakety do lokální sítě nedostanou a NetMon je tedy nezaznamená.
Možnosti, jak tuto situaci řešit, jsou následující:
- Nastavit NetMon tak, aby sledoval i komunikaci uživatelů s mailserverem (data by se tedy sledovala až v okamžiku, kdy si je koncový uživatel z mailserveru stáhne). To lze provést obdobně jako nastavení pro proxy server (viz kap. Konfigurace programu - IP addresses) - všechny adresy, protokol TCP, port 110 (POP3), budou prohlášeny "on Internet". Pak bude NetMon sledovat i přenesenou poštu, ovšem včetně lokální pošty, kterou si uživatelé ve vaší síti posílají mezi sebou.
- Umístit mailserver na jiný ("vnitřní") počítač. Pak není třeba NetMon nijak nastavovat - komunikace mailserveru s dalšími mailservery v Internetu bude sledována správně a komunikace lokálních uživatelů s mailserverem sledována nebude.