Grantová agentura ČR podporuje základní výzkum v pěti základních oborech:
Každý z těchto základních oborů dále dělí GA ČR na podobory a každý podobor má své číslo. Pro zařazení návrhu projektu do příslušné podoborové komise se používá toto dělení.
Pro každý z uvedených oborů jsou ustaveny
oborové komise (OK), které jsou poradními orgány předsednictva GA ČR. Jejich členové jsou voleni podle volebního řádu OK předsednictvem GA ČR a Radou vlády pro výzkum a vývoj na základě návrhů institucí zabývajících se výzkumem a vývojem. Návrhy kandidátů podávají instituce na návrhovém listuOborové komise jsou složeny z odborníků pracujících v jednotlivých vědních oblastech a mají podle Statutu GA ČR 10 až 25 členů. Funkční období v oborové komisi je tříleté, znovu může být vykonáváno po tříleté přestávce. Každá oborová komise má svého předsedu, který je volen členy oborové komise na dobu jednoho roku; daný člen může tuto funkci zastávat max. dvě po sobě následující funkční období.
Každá oborová komise může podle potřeby zřizovat podoborové komise (POK), jejichž členy jmenuje předseda oborové komise na základě návrhů členů OK a po projednání s předsednictvem GA ČR. Členové POK plní funkci zpravodajů grantových projektů. Souhrnná délka členství v OK a POK může být max. šest let. Seznam členů oborových a podoborových komisí je uveřejňován v Bulletinu GA ČR a na internetové stránce GA ČR.
Pro potřeby centrální evidence projektů (CEP) byl vytvořen Radou vlády pro výzkum a vývoj ještě specielní číselník oborů, který je nutno použít pro odbornou charakteristiku navrhovaného projektu v grantové přihlášce.