\verb|A\hbox{\hbox{\vbox{\hbox{あ}}}あ}A| & A\hbox{\hbox{\vbox{\hbox{あ}}}あ}A \\
を処理中に起きています。この部分のみの小さなTEXファイルを処理しても同じことが起こりますので、TEXファイルの大きさやメモリの容量に問題があるのではなく、メモリ中の内容が何等かの原因で壊されているのではないかと思われます。
同じTEXファイルをWindows NT上で処理した場合（つまり、Win32sを必要としない環境で行った場合）にはエラーが発生しませんので、Win32sが絡んだ問題かと思われます。
さて、1.0cバージョンアップでは、Big TEXなどの32ビットモジュールをすべて Windows NT 3.5上で作成しなおしました。このバージョンのBig TEXでは、 この問題が起きないことを確認しました。