Det er gjort en rekke større utgravninger i middelalderens Åbo. I 1995 var det utgravninger på et stort område i det s.k. klosterkvarteret ved Aura-elven ca. 250 m nedenfor domkirken. Under utgravningene fant man deler av et område som i middelalderen besto av flere steinbygninger og gater. Steinhusene ble bygd senest i begynnelsen av 1400-tallet, og alt da dekket de over eldre bosetning og kulturlag. Kjellerne og steinbygningene var velbevarte, og rundt dem er museet Aboa Vetus anlagt. Under utgravningene ble det tatt vare på store mengde funn fra 1800-tallet og bakover til overgangen mellom 1200-tallet og 1300-tallet.